一九九九年九月二十一日凌晨1時47分，台灣發生了世紀的強震，為戰後傷亡損失最慘重的天災，這場地震奪走無數生命，為台灣留下了重大創痛，卻也激發出台灣人的互助互愛精神；而南投靈糧堂就是在此時，為回應「基督愛世人，與哀哭的人同哭」的聖經教訓而產生的。

    起初災區的工作，先是由台北母堂以接力式的短期賑災團隊到南投服務，之後周神助牧師因看到這不是短時間可以完成的工作，因而呼籲徵召母堂有負擔的兄姊們，能放下工作，成為921宣教士，以二年為單位，常駐災區與災民同住；那時有許多人回應，於是各在受災較嚴重的地點：東勢鎮，埔里鎮，名間鄉，南投市四個點設立工作站，之後才分別轉型為教會，而謝明宏牧師，楊品嫻姊妹，鄭如齡姊妹與周盎滿牧師就是在那時來到南投市的。

我們是在2000.3.7遷入南投市， 兩週後3.21舉行開工禮拜，初期名為南投靈糧分享之家，一年七個月之後，於 2001.11.3正式設立成為教會，名為南投靈糧堂。初期由謝明宏牧師帶領我們同心建造，打下美好根基，二年後台北來的同工們陸續北返，謝明宏牧師亦於2003年被召回母堂另有重用，於是由周盎滿牧師接任教會主責傳道。剛接任時實在是戰戰兢兢，深恐壞了 神國大事，但 神是奇妙又奇妙的那位，不但供應教會一切所需，也深知盎滿牧師的需要，正就在交接的時刻，神將盎滿牧師生命中最重要的人，謝天仁宣教士自美國帶來南投，成為盎滿牧師的丈夫，使兩人能並肩前行一起同心繼續建造教會，而從此教會亦進入另一個新的階段。

    從台北來到南投，神以約翰福音第十二章26節「若有人服事我，就當跟從我；我在哪裡，服事我的人也要在那裡；若有人服事我，我父必尊重他」呼召我。
   教會建造之初，面對龐大的需要，常常感到自身的渺小與不足，因而更加迫切的呼求聖靈幫助我，我實在需要祂的能力和智慧，不久 神以使徒行傳一章八節「但聖靈降臨在你們身上，你們就必得著能力，並要在耶路撒冷、猶太全地，和撒馬利亞，直到地極，作我的見證」。感動我要建造一個宣教的教會，而使徒行傳就是聖靈行傳，也就是說我們要在聖靈的帶領下在本地和遠處傳天國的福音，範圍就是「耶路撒冷(南投市)、猶太全地(南投縣)，和撒馬利亞(亞太地區)，直到地極(以色列、以實馬利)」。

　所以，我們是宣教的教會，新婦的教會。

• 得著南投百姓及其家庭作主門徒，在南投各地建立小組。


• 藉AEF計畫得著兒童、青年，並以耶路撒冷為宣教指標、致力於培養神國宣教士。


• 建立24小時禱告中心。


• 恢復原住民肢體利未恩膏，參與台灣轉化。


• 建立五重職事團隊，向四圍鄉鎮及海外宣教植堂